生产追溯系统不能满足网络时代特征的要求。随着互联网时代的到来，电子商务的兴起，数字经济已经影响到社会经济生活中的方方面面。但生产追溯系统软件系统还处于初始阶段，对电子商务的支持也尚未成熟。传统生产追溯系统不能适应跨地域异地应用，更不能为虚拟产业联盟提供从供应商到合作伙伴和客户的有效管理手段。

 

企业的生产追溯系统与供应链结合不紧密。生产追溯系统虽然是面向供应链管理,但其重心仍在企业内部。激烈的买方市场竞争中，客户已经成为企业兴衰的关键。如何以客户为中心，提高客户的满意度和忠诚度是生产追溯系统要改善的一个重要环节。

 

生产追溯系统无法满足企业个性化管理的需求。随着管理理论和IT技术的不断创新、市场需求的不断变化，企业流程也必然随之而改变，而目前生产追溯系统还不能动态地满足企业流程变化的需要，必须经过艰难的二次开发和实施才能实现。虽然一些生产追溯系统公司正在进行动态企业建模的探索，但都还处于初级阶段。

 

生产追溯系统的集成程度低。尽管很多企业开展了电子商务业务，但是由于生产追溯系统没有进行集成，使得从平台上获得的销售定单、市场信息不能及时传递到后台生产追溯系统中，前台生产追溯系统不能共享信息，造成前后台信息的脱节，这就导致客户满意度的下降，甚至失去客户。